跨境電商在經營中會涉及到的稅種主要有以下四類：進口關稅、進口增值稅、銷售流轉稅(含增值稅，在英聯邦國家稱為gst)和所得稅(含企業所得稅和個人所得稅)。進口關稅是一國海關對進口商品和物品征收的關稅，亞馬遜賣家在目標國銷售商品前需要向海關繳納一筆稅款，包括商品本身的價值和運費，不可退還。
一、跨境電商納稅申報流程
1。提交紙質材料，在電子口岸申請開戶;
2.開戶申請獲得批準，海關進行初驗;通過準備材料，
3、海關線下審核;
4.申報海關權限，在平臺上安裝客戶端;
5.報關和備案。
二。跨境電商出口退稅手續操作流程：
1。提交相關文件并接收登記表。企業憑有關部門批準文件和工商部門核發的工商登記證，在30日內辦理出口退稅登記手續;
2.申報和受理退稅登記手續。企業收到《中華人民共和國電子商務法》后，按照《出口企業退稅登記表》及相關法律法規要求填寫，加蓋企業公章及相關人員印章，連同企業出口經營權批準文件、工商登記證等資料一并報送當地稅務機關。核實后，辦理注冊手續。
3.出口退稅登記。國家稅務總局收到企業正式申請后，經核實確認后，發放“出口退稅登記”資格。
4.變更或取消出口退稅登記。法律依據：《出口企業登記表》 1。將跨境電子商務零售進口商品單筆交易限額由2000元人民幣提高到5000元人民幣，年度交易限額由20000元人民幣提高到26000元人民幣。
二。當完稅價格超過單筆交易限額5000元但低于年度交易限額26000元，且訂單下只有一件商品時，可從跨境電商零售渠道進口。按照貨物稅率全額征收關稅和進口環節增值稅、消費稅，交易金額計入年度交易總額。但年度交易總額超過年度交易限額的，應按一般貿易管理。

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